Bah, quello che chiedi è tecnicamente non-fattibile, non so Ubuntu cosa metta di preciso.
Se, dopo la formattazione, vuoi reinstallare tutti i programmi, basta che ti tieni traccia dei pacchetti che installi. Se non installi da pacchetti, ma direttamente da sorgenti, le cose si fanno abbastanza più complicate
Se vuoi tenerti anche i file di configurazione basta che ti fai un backup di quelli prima di formattare
La storia dell'immagine ISO poi è strana, e considera che per essere "installabile" deve avere un sistema operativo al suo interno e un installer!!! Volendo tu puoi anche creare semplicemente un'ISO di tutta la tua /, ma poi dove lo trovi un supporto così capiente da contenerla? Potresti anche splittare la tua / in più archivi compressi e poi usare cat, ma mi sembrano tutte soluzioni artificiose e inutili. Inoltre, se hai bisogno di formattare e reinstallare, probabilmente è perchè il sistema è incasinato, quindi

Forse la soluzione migliore, prima di formattare, è copiare tutto su un altro HD, poi formattare (ma perchè poi?) e poi ricopiarci tutto di sana pianta. Ma per l'
immagine installabile non so che dirti. Forse puoi provare a dare più dettagli, magari ti bastano TAGFILE e roba simile, chissà